A szerves szintézisben fontos katalizátor és redukálószer, a trifenilfoszfin nagy toxicitása miatt kihívást jelent, hatékony alkalmazása ellenére. A kémiai reagens biztonságos eltávolításához a következő három módszert javasoljuk:
Először lúgos kezelés: nátrium-hidroxiddal vagy lúgos nátrium-karbonáttal reagáltatva vízben{0}}oldható sót állítanak elő, majd mosás és szűrés következik. Másodszor, aktív szén adszorpció: az aktív szén erős adszorpciós tulajdonságainak felhasználása a trifenil-foszfin hatékony kiszűrésére. Végül, magas-hőmérsékletű, nagy-vákuumdesztilláció: a hőmérséklet és a vákuum precíz szabályozása a trifenil-foszfin pontos elválasztása érdekében.
A trifenilfoszfint tartalmazó szennyvíz kezelésekor be kell tartani a helyi környezetvédelmi előírásokat. Semlegesítéssel a szennyvíz pH-értékét állíthatjuk be, majd aktív szén adszorpcióval távolíthatjuk el a szerves anyagokat. Alternatív megoldásként vegyszeres kezelés is alkalmazható a trifenil-foszfin kevésbé mérgező vegyületté történő redukálására, majd ezt követik a szokásos szennyvízkezelési eljárások. Ezek a módszerek nemcsak a trifenil-foszfin biztonságos felhasználását biztosítják, hanem a szennyvizek ártalmatlan tisztítását is, garantálva a zöld és biztonságos termelési környezetet.
